Toto je dosiaľ najlepšia časť článku a dávam klobúk dole pred autorovou vytrvalosťou, pretože doviesť úvahy po toľkých vetvách k záverom a nezatúlať sa pri prvej odbočke vyžaduje skutočne veľa, veľa premýšľania a štúdia.
Autor sa letmo dotkol odlišnosti antigénov súvisiacich s ochorením a s očkovaním. Uvediem len niekoľko príkladov k zamysleniu. Toxoidové vakcíny (záškrt, tetanus, čierny kašeľ) obsahujú adsorbovaný toxín. Skutočný bakteriálny jed je najprv inaktivovaný formaldehydom a potom prilepený na hliníkový nosič. Ťažko povedať, čo tento "denaturačný" proces urobí s molekulou, ale dá sa predpokladať, že sa môžu zmeniť uhly, pribudnúť atómy na niektorých pozíciách, alebo sa môže úplne rozlámať. A potom je ešte vystavená koktejlu ďalších chemikálií, ktoré tvoria súčasti vakcíny.
Už bol zaznamenaný prípad, keď na tetanus ochorel človek, ktorý mal vysokú hladinu protilátok z očkovania, ktoré dobre reagovali s vakcínovými antigénmi, ale neboli schopné väzby na skutočný tetanický toxín.
Ďalej napríklad protilátky z očkovania sa viažu len na polovicu kmeňov vírusu osýpok, pritom protilátky po prekonaní ochorenia sa viažu na 90% kmeňov. Osýpková vakcína spočíva v živom víruse, takže antigén by mal byť totožný. Avšak injekčný vstup, ktorý je pri osýpkovom víruse zjavne neprirodzený (obchádza slizničnú imunitu), zjavne spôsobuje odlišné spracovanie antigénu a tým pádom odlišný výsledok.
Ak niekto v dnešnej dobe tvrdí, že očkovanie napodobňuje prirodzený priebeh ochorenia, tak to je tak hrubé zjednodušenie, až mám podozrenie, že ide skôr o ignoranciu.