Ještě jedna nepříznivá vlastnost sóji (bohužel je to obecně vlastnost luštěnin, i když sója ji má ve větší míře).
Je to přímo magnet na těžké kovy - pokud se tedy pěstuje v oblasti více zasažené těžkými kovy (což třeba v Číně vzhledem k tomu, že se tam často zpracovává elektrotechnický šrot je celkem pravděpodobné), tak má velkou tendenci je do sebe přijímat (jako houby "rády" přijímají radioaktivní látky).