Spouštěčem autoimunitního onemocnění může být vakcinace, to je známá věc.
O narkolepsii se nevědělo (nebo alespoň ne jistě), že se jedná o autoimunitní onemocnění až do roku 2009, kdy se podařilo vyrobit vakcínu, která narkolepsii u predisponovaných jedinců způsobuje:
http://ecdc.europa.eu/en/publications/Publications/Vaesco%20report%20FINAL%20with%20cover.pdf
Vakcína proti hepatitidě B zase může vést k rozvoji roztroušené sklerózy:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4266455/
i když samozřejmě existují opačné studie, které to vyvracejí...