V kořenech čekanky je obsažen zásobní polysacharid inulin (až 15 %), tvořený zbytky molekul fruktózy. Je to hydroskopický bílý prášek bez chuti a zápachu, který se používá jako výživa pro diabetiky. Čekanka obecná obsahuje dále třísloviny, manit, kaučuk, cholin, arginin a také množství minerálních látek.